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Yaxin-1165/1168熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)數(shù)據(jù)導(dǎo)出與整理的方法

 更新時間:2024-08-28 點擊量:2291

本文檔適用于北京雅欣理儀科技有限公司生產(chǎn)的Yaxin-1165植物熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)與Yaxin-1168藻類熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)的數(shù)據(jù)整理功能。主要包括數(shù)據(jù)傳輸、電腦端(上位機(jī)軟件)查看、導(dǎo)出、在EXCEL中重整理等過程。


1.數(shù)據(jù)導(dǎo)出


首先連接儀器與電腦的傳輸線,其次在儀器端點擊【數(shù)據(jù)管理】,進(jìn)入下一界面再點擊【數(shù)據(jù)傳輸】。接下來有兩種模式可供用戶選擇,分別是【虛擬U盤模式】和【轉(zhuǎn)存到SD卡】,兩個模式選擇其中一個方式即可完成數(shù)據(jù)傳輸。



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1.1 數(shù)據(jù)傳輸


【虛擬U盤模式】:選擇【虛擬U盤模式】后,用數(shù)據(jù)線連接電腦,電腦會自動彈出U盤。打開U盤后,可以顯示已經(jīng)保存的文件,最新日期的文件為最后一次導(dǎo)出的數(shù)據(jù),將文件復(fù)制在電腦目標(biāo)文件夾下,后使用 PrjYG2021DV數(shù)據(jù)傳輸軟件查看數(shù)據(jù)。

注:在熒光儀主機(jī)的數(shù)據(jù)查看與刪除功能詳見說明書,該處不做介紹。


2  數(shù)據(jù)查看
2.1 PC端文件打開操作
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圖2.1 PrjYG2021DV軟件截圖


PrjYG2021DV數(shù)據(jù)傳輸軟件為Yaxin-1165植物熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)配套的數(shù)據(jù)傳輸軟件,雙擊打開即可進(jìn)入軟件,軟件圖標(biāo)如圖2.1。



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圖2.2 數(shù)據(jù)傳輸界面


操作界面如圖2.2,包括軟件名、表格/曲線查看模式、參數(shù)列、給光模式、 測量類型和文件名等信息,軟件右側(cè)第一列點擊【打開文件】。



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圖2.3 文件打開


界面彈出“打開文件"的界面,如圖2.3,選擇需要查看的文件(文件格式“.bin"),雙擊即可在軟件中查看。


2.2 單個“OJIP測量"的表格和圖片查看


以O(shè)JIP為例,在“測量類型"中選擇“OJIP",文件名框中則出現(xiàn)測量OJIP的各個文件,單擊選擇可進(jìn)行查看。在表格/曲線查看模式中可選擇查看類型,表格模式如圖2.4,曲線模式如圖2.5。



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圖2.4 OJIP表格模式                    

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圖2.5 OJIP曲線模式
2.3 多個“OJIP測量"的表格數(shù)據(jù)和圖片查看


在表格模式下的OJIP模塊,按住Ctrl鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行數(shù)據(jù)查看,可以用來比對多項OJIP數(shù)據(jù),表格模式如圖2.6。在曲線模式下的OJIP模塊,按住 Ctrl鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行曲線查看,比對多條OJIP曲線差異,曲線模式如圖2.7。



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圖2.6 多個OJIP表格模式                    

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圖2.7 多個OJIP曲線模式
2.3 多個“脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)" 的表格數(shù)據(jù)和圖片查看


在表格模式下的脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)模塊,按住 Ctrl 鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行數(shù)據(jù)查看,可以用來比對多項脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)數(shù)據(jù),表格模式如圖2.8。在曲線模式下的脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)模塊,按住 Ctrl 鍵可以多選文件名框中的文件進(jìn)行曲線查看,由于脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)數(shù)據(jù)較多,需要在操作欄中選擇一項數(shù)據(jù)進(jìn)行比對,曲線模式如圖2.9。


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圖2.8 多個脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)表格模式                    
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圖2.9 多個脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線模式
3  數(shù)據(jù)導(dǎo)出


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圖3.1 OJIP測量模式下的表格查看界面


在表格模式下如圖3.1,選擇文件后,點擊表格上方的【保存表格】,可將表格中的數(shù)據(jù)(呈現(xiàn)在軟件表格中的數(shù)據(jù),換言之計算值)以.csv格式保存到PC端,后續(xù)用Excel即可查看或編輯。

選中文件后,點擊文件名框右側(cè)的【另存為】—【保存選中的數(shù)據(jù)(表格形式)】,(如圖3.2)可將對應(yīng)文件的原始數(shù)據(jù)以.csv格式保存到 PC 端,后續(xù)用Excel可以根據(jù)導(dǎo)出的數(shù)據(jù)作圖。

注意:【保存表格】和【另存為】這兩個途徑均可以導(dǎo)出csv格式的數(shù)據(jù)。【保存表格】方式導(dǎo)出的是呈現(xiàn)在軟件表格中的數(shù)據(jù)?!玖泶鏋椤繉?dǎo)出的是原始數(shù)據(jù),原始數(shù)據(jù)為隨時間推移的熒光值,如第一列是時間,第二列是熒光值。【保存表格】包括部分測量值和全部計算值?!玖泶鏋椤繉?dǎo)出的數(shù)據(jù)沒有計算值,是實測值。



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圖3.2 儲存方式


選擇【保存所有測量類型數(shù)據(jù)】、【保存當(dāng)前測量類型數(shù)據(jù)】、【保存選中的數(shù)據(jù)】這三個選項所保存的數(shù)據(jù)均為.bin格式,該格式不能用 Excel 表格正確讀取,只能用我司配套的軟件打開。


4  數(shù)據(jù)重整理
4.1導(dǎo)出數(shù)據(jù)如何手工繪制OJIP曲線


找到【另存為】導(dǎo)出的格式為.csv的文件,用EXCEL打開該文件,選中Times(時間)及D1(熒光值)的所有數(shù)據(jù)如圖4.1所示。



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4.1 csv文件數(shù)據(jù)框選


點擊工具欄中的插入界面,進(jìn)入圖標(biāo)欄,插入帶平滑線的散點圖,即可得到圖4.2。


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4.2 帶平滑線的散點圖


隨后對該圖片中的橫坐標(biāo)進(jìn)行“對數(shù)化"處理。點擊帶平滑線散點圖的橫坐標(biāo)數(shù)字,出現(xiàn)操作界面,在界面中點擊對數(shù)刻度,如圖4.3,即可得到OJIP曲線,如圖4.4。



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4.3 對數(shù)化處理
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4.4 繪制OJIP曲線
4.2導(dǎo)出數(shù)據(jù)如何繪制脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線?


脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線俗稱“熒光曲線",該曲線指的是在飽和脈沖與作用光相互的作用下,熒光值隨時間變化的曲線。如何繪制呢?

在表格模式下如圖4.5,選擇要保存的脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)數(shù)據(jù),點擊右側(cè)的【另存為】,可將表格中的數(shù)據(jù)以.csv格式保存到PC端,后續(xù)用Excel即可查看或編輯,選擇存儲方式如圖4.6。



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4.5 表格模式另存為
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4.6 選擇儲存方式


找到保存的格式為.csv的文件,如圖4.7。

第一行分別為文件名,日期、時間、測量項(slowkin)及設(shè)定的參數(shù)SL=8000,n=6,AL=400。

第二行是數(shù)字,每個數(shù)字代表一個給光階段,如1代表飽和脈沖,2代表光化光,3代表再次飽和脈沖,4代表再次光化光階段。

第三行分別給出該階段所用光照的強(qiáng)度。OJIP(8000/1s)代表飽和脈沖的強(qiáng)度和時間,PulseMeas(AL400:30s)代表光化光的強(qiáng)度和時間。

第四行time代表時間,D1和D2代表實測的數(shù)據(jù)。



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4.7  excel打開csv格式的脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)原始數(shù)據(jù)文件


繪制脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線(熒光值隨時間變化的曲線)時,表格中的數(shù)據(jù)按照每個階段成一列給出。如第一個飽和脈沖為如圖4.7第1和2列,第一個光化光數(shù)據(jù)為第3-5列,以此類推。建議選擇飽和脈沖中的最大熒光值即Fm(Fm’)和光化光的所有值,按照時間先后排序為一列作圖即可。

以六次飽和脈沖光為例,建議制作脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線x軸時間選取數(shù)據(jù)共157個,選取0.5 s、1-30s、30.5s、31-60s、60.5s、61-90s、90.5s、91-120s、120.5s、121-150s、150.5s,選擇好后排為一列作圖。

具體時間分別為500ms、1s、2 s、3 s、4 s、5 s、6 s、7 s、8 s、9 s、10 s、11 s、12 s、13 s、14 s、15 s、16 s、17 s、18 s、19 s、20 s、21 s、22 s、23 s、24 s、25 s、26 s、27 s、28 s、29 s、30 s、30.5 s、31 s、32 s、33 s、34s、35s、36 s、37 s、38 s、39 s、40 s、41 s、42 s、43 s、44 s、45 s、46 s、47 s、48 s、49 s、50 s、51 s、52 s、53 s、54 s、55 s、56 s、57 s、58 s、59 s、60 s、60.5 s、61 s、62 s、63 s、64 s、65 s、66 s、67 s、68 s、69 s、70 s、71 s、72 s、73 s、74 s、75 s、76 s、77 s、78 s、79 s、80 s、81 s、82 s、83 s、84 s、85 s、86 s、87 s、88 s、89 s、90 s、90.5 s、91 s、92 s、93 s、94 s 、95 s 、96 s 、97 s 、98 s 、99 s 、100 s、101 s 、102 s 、103 s 、104 s 、105 s、106 s、107 s、108 s、109 s、110 s、111 s、112 s、113 s、114 s、115 s、116 s、117 s、118 s、119 s、120 s、120.5 s、121 s、122 s、123 s、124 s、125 s、126 s、127 s、128 s、129 s、130 s、131 s、132 s、133 s、134 s、135 s、136 s、137 s、138 s、139 s、140 s、141 s、142 s、143 s、144 s、145 s、146 s、147 s、148 s、149 s、150 s、150.5 s。

將所選取的時間點作為x軸坐標(biāo)數(shù)據(jù),在導(dǎo)出表格中其所對應(yīng)的D1數(shù)據(jù)為y軸數(shù)據(jù),新建excel表格粘貼兩組數(shù)據(jù),框選兩組數(shù)據(jù),點擊工具欄中的插入界面,進(jìn)入圖標(biāo)欄,插入帶平滑線的散點圖。


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4.8  excel完成的脈沖瞬態(tài)熒光動力學(xué)曲線圖


以上內(nèi)容為Yaxin-1165植物熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)與Yaxin-1168藻類熒光動力學(xué)測量系統(tǒng)的數(shù)據(jù)整理功能。尤其重點介紹了數(shù)據(jù)導(dǎo)出后如何在EXCEL中根據(jù)數(shù)據(jù)繪制圖形等過程。其他部分可以詳見產(chǎn)品使用指南。


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我們針對數(shù)據(jù)整理也推出了視頻版,可以在我司或公眾號跟著視頻學(xué)習(xí)。此外,對于有需要原始數(shù)據(jù)表格模板的同學(xué),或?qū)ξ宜救~綠素?zé)晒鈩恿W(xué)測量系統(tǒng)應(yīng)用指南(實驗指導(dǎo))感興趣的同學(xué),可以聯(lián)系我司工程師,一對一傳送。





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